MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022784	TAG	2	6	211547	211552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625447
2502	NC_022784	TTA	2	6	211597	211602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625447
2503	NC_022784	CAGTA	2	10	211674	211683	40 %	20 %	20 %	20 %	557625447
2504	NC_022784	TAATG	2	10	211727	211736	40 %	40 %	20 %	0 %	557625447
2505	NC_022784	AAG	2	6	211737	211742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625447
2506	NC_022784	GGT	2	6	211745	211750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625447
2507	NC_022784	TAC	2	6	211840	211845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625448
2508	NC_022784	AAG	2	6	211855	211860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625448
2509	NC_022784	GTA	2	6	211880	211885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625448
2510	NC_022784	AGGC	2	8	211969	211976	25 %	0 %	50 %	25 %	557625448
2511	NC_022784	GATG	2	8	212044	212051	25 %	25 %	50 %	0 %	557625448
2512	NC_022784	TGG	2	6	212061	212066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625448
2513	NC_022784	TAC	2	6	212109	212114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625448
2514	NC_022784	GAG	2	6	212180	212185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625448
2515	NC_022784	TGT	2	6	212187	212192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625448
2516	NC_022784	GGA	2	6	212287	212292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625448
2517	NC_022784	TGG	2	6	212331	212336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625448
2518	NC_022784	AGA	2	6	212346	212351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625448
2519	NC_022784	AG	3	6	212366	212371	50 %	0 %	50 %	0 %	557625448
2520	NC_022784	AGT	2	6	212431	212436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625448
2521	NC_022784	GA	3	6	212450	212455	50 %	0 %	50 %	0 %	557625448
2522	NC_022784	TAC	2	6	212583	212588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625448
2523	NC_022784	AAG	2	6	212600	212605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625448
2524	NC_022784	TA	3	6	212679	212684	50 %	50 %	0 %	0 %	557625448
2525	NC_022784	GAA	2	6	212689	212694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625448
2526	NC_022784	GGA	2	6	212695	212700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625448
2527	NC_022784	TTC	2	6	212720	212725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625448
2528	NC_022784	GA	3	6	212884	212889	50 %	0 %	50 %	0 %	557625448
2529	NC_022784	AGT	2	6	212934	212939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625448
2530	NC_022784	AGG	2	6	213123	213128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625449
2531	NC_022784	GTT	2	6	213164	213169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625449
2532	NC_022784	GTT	2	6	213233	213238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625449
2533	NC_022784	GCA	2	6	213242	213247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625449
2534	NC_022784	TGA	2	6	213248	213253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625449
2535	NC_022784	TCT	2	6	213285	213290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625449
2536	NC_022784	GAG	2	6	213297	213302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625449
2537	NC_022784	GAT	2	6	213314	213319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625449
2538	NC_022784	ACA	2	6	213403	213408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625450
2539	NC_022784	GAT	2	6	213471	213476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625450
2540	NC_022784	GAT	2	6	213525	213530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625450
2541	NC_022784	GCA	3	9	213577	213585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625450
2542	NC_022784	TGA	2	6	213641	213646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625450
2543	NC_022784	GGT	2	6	213647	213652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625450
2544	NC_022784	ATG	2	6	213658	213663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625450
2545	NC_022784	TGA	2	6	213733	213738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625450
2546	NC_022784	AGC	2	6	213774	213779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625450
2547	NC_022784	CG	3	6	213895	213900	0 %	0 %	50 %	50 %	557625451
2548	NC_022784	ATG	2	6	213934	213939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625451
2549	NC_022784	ATA	2	6	214009	214014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625451
2550	NC_022784	GAA	2	6	214058	214063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625451
2551	NC_022784	GCT	2	6	214065	214070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625451
2552	NC_022784	TCC	2	6	214086	214091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625451
2553	NC_022784	GTT	2	6	214134	214139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625451
2554	NC_022784	TGG	2	6	214201	214206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625451
2555	NC_022784	GTT	2	6	214282	214287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625451
2556	NC_022784	GAG	2	6	214299	214304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625451
2557	NC_022784	GGT	2	6	214415	214420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625452
2558	NC_022784	TGT	2	6	214508	214513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625452
2559	NC_022784	AAAG	2	8	214541	214548	75 %	0 %	25 %	0 %	557625452
2560	NC_022784	CAT	2	6	214694	214699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625452
2561	NC_022784	GGA	2	6	214778	214783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625452
2562	NC_022784	TGC	2	6	214811	214816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625452
2563	NC_022784	GT	3	6	214864	214869	0 %	50 %	50 %	0 %	557625452
2564	NC_022784	CTG	2	6	215049	215054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625453
2565	NC_022784	AGGA	2	8	215072	215079	50 %	0 %	50 %	0 %	557625453
2566	NC_022784	TGT	2	6	215107	215112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625453
2567	NC_022784	GAA	2	6	215113	215118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625453
2568	NC_022784	GCA	2	6	215252	215257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625453
2569	NC_022784	ATG	2	6	215286	215291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625453
2570	NC_022784	TGC	2	6	215301	215306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625453
2571	NC_022784	GTG	2	6	215318	215323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625453
2572	NC_022784	T	6	6	215324	215329	0 %	100 %	0 %	0 %	557625453
2573	NC_022784	CAT	2	6	215340	215345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625453
2574	NC_022784	TGG	2	6	215425	215430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625453
2575	NC_022784	CGT	2	6	215476	215481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625453
2576	NC_022784	TGGG	2	8	215507	215514	0 %	25 %	75 %	0 %	557625453
2577	NC_022784	AGA	2	6	215654	215659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625454
2578	NC_022784	CTG	3	9	215701	215709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625454
2579	NC_022784	AGA	2	6	215729	215734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625454
2580	NC_022784	CAGA	2	8	215751	215758	50 %	0 %	25 %	25 %	557625454
2581	NC_022784	TCG	2	6	215761	215766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625454
2582	NC_022784	GA	3	6	215819	215824	50 %	0 %	50 %	0 %	557625454
2583	NC_022784	CAC	2	6	215828	215833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625454
2584	NC_022784	GAAG	2	8	215843	215850	50 %	0 %	50 %	0 %	557625454
2585	NC_022784	AAG	2	6	215869	215874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625454
2586	NC_022784	AG	3	6	215880	215885	50 %	0 %	50 %	0 %	557625454
2587	NC_022784	AAG	2	6	215898	215903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625454
2588	NC_022784	AGA	2	6	215932	215937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625454
2589	NC_022784	AGT	2	6	215971	215976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625454
2590	NC_022784	TGG	2	6	215990	215995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625454
2591	NC_022784	T	6	6	215996	216001	0 %	100 %	0 %	0 %	557625454
2592	NC_022784	TCT	2	6	216015	216020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625454
2593	NC_022784	TTC	2	6	216029	216034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625454
2594	NC_022784	AGC	2	6	216180	216185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625455
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2596	NC_022784	ACA	2	6	216262	216267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625455
2597	NC_022784	ATG	2	6	216283	216288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625455
2598	NC_022784	TGT	2	6	216350	216355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625455
2599	NC_022784	AGG	2	6	216367	216372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625455
2600	NC_022784	TGA	2	6	216401	216406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625455
2601	NC_022784	AT	3	6	216431	216436	50 %	50 %	0 %	0 %	557625455
2602	NC_022784	GAT	2	6	216470	216475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625455
2603	NC_022784	CG	4	8	216605	216612	0 %	0 %	50 %	50 %	557625455
2604	NC_022784	ATTT	2	8	216666	216673	25 %	75 %	0 %	0 %	557625455
2605	NC_022784	AAG	2	6	216684	216689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625455
2606	NC_022784	TTG	2	6	216811	216816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625455
2607	NC_022784	A	6	6	216911	216916	100 %	0 %	0 %	0 %	557625455
2608	NC_022784	AGT	2	6	217002	217007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625455
2609	NC_022784	AC	3	6	217135	217140	50 %	0 %	0 %	50 %	557625455
2610	NC_022784	TTC	2	6	217254	217259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625455
2611	NC_022784	GTT	2	6	217284	217289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625455
2612	NC_022784	AGT	2	6	217370	217375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625455
2613	NC_022784	TGC	2	6	217390	217395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625455
2614	NC_022784	TGA	2	6	217415	217420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625455
2615	NC_022784	ACC	2	6	217426	217431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625455
2616	NC_022784	GGA	2	6	217756	217761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625455
2617	NC_022784	AGC	2	6	217806	217811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625455
2618	NC_022784	AT	3	6	217818	217823	50 %	50 %	0 %	0 %	557625455
2619	NC_022784	GTG	2	6	217881	217886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625455
2620	NC_022784	AGG	2	6	217918	217923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625455
2621	NC_022784	GAT	2	6	217980	217985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625455
2622	NC_022784	CT	3	6	218084	218089	0 %	50 %	0 %	50 %	557625455
2623	NC_022784	CGGTG	2	10	218225	218234	0 %	20 %	60 %	20 %	557625455
2624	NC_022784	TA	3	6	218280	218285	50 %	50 %	0 %	0 %	557625455
2625	NC_022784	CAA	2	6	218306	218311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625455
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2630	NC_022784	GCT	2	6	218786	218791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625455
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2636	NC_022784	GCT	2	6	219129	219134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625455
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2643	NC_022784	CAC	2	6	219810	219815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625455
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2646	NC_022784	GAT	2	6	219990	219995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625455
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2650	NC_022784	GGC	2	6	220328	220333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625456
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2740	NC_022784	GC	3	6	225981	225986	0 %	0 %	50 %	50 %	557625458
2741	NC_022784	T	6	6	226006	226011	0 %	100 %	0 %	0 %	557625458
2742	NC_022784	ACG	2	6	226100	226105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625458
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2744	NC_022784	GTA	2	6	226436	226441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625458
2745	NC_022784	GGA	2	6	226450	226455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625458
2746	NC_022784	AGC	2	6	226458	226463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625458
2747	NC_022784	ATA	2	6	226493	226498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625458
2748	NC_022784	GCAG	2	8	226521	226528	25 %	0 %	50 %	25 %	557625458
2749	NC_022784	CGT	2	6	226593	226598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625458
2750	NC_022784	AGC	2	6	226606	226611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625458
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2765	NC_022784	TGCA	2	8	227503	227510	25 %	25 %	25 %	25 %	557625458
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2770	NC_022784	TG	3	6	227764	227769	0 %	50 %	50 %	0 %	557625458
2771	NC_022784	GGTAC	2	10	227938	227947	20 %	20 %	40 %	20 %	557625458
2772	NC_022784	AGC	2	6	228157	228162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625458
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2775	NC_022784	GC	3	6	228374	228379	0 %	0 %	50 %	50 %	557625458
2776	NC_022784	GAT	2	6	228382	228387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625458
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2850	NC_022784	AAC	2	6	233926	233931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625463
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2856	NC_022784	ATAC	2	8	234128	234135	50 %	25 %	0 %	25 %	557625463
2857	NC_022784	ACG	2	6	234142	234147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625463
2858	NC_022784	TG	3	6	234163	234168	0 %	50 %	50 %	0 %	557625463
2859	NC_022784	GCA	2	6	234197	234202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625463
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2862	NC_022784	TCAC	2	8	234534	234541	25 %	25 %	0 %	50 %	557625464
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2864	NC_022784	TTTG	2	8	234606	234613	0 %	75 %	25 %	0 %	557625464
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2987	NC_022784	CGA	2	6	241467	241472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625472
2988	NC_022784	CTC	2	6	241545	241550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625472
2989	NC_022784	GCT	2	6	241552	241557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625472
2990	NC_022784	GCGCA	2	10	241564	241573	20 %	0 %	40 %	40 %	557625472
2991	NC_022784	AGG	2	6	241631	241636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625472
2992	NC_022784	GCTG	2	8	241638	241645	0 %	25 %	50 %	25 %	557625472
2993	NC_022784	GAG	2	6	241702	241707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625472
2994	NC_022784	GA	3	6	241765	241770	50 %	0 %	50 %	0 %	557625472
2995	NC_022784	ATG	2	6	241775	241780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625472
2996	NC_022784	GAT	2	6	241795	241800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625472
2997	NC_022784	GGT	2	6	241840	241845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625472
2998	NC_022784	CAA	2	6	241857	241862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625472
2999	NC_022784	GGAAGT	2	12	241866	241877	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	557625472
3000	NC_022784	CAG	2	6	242003	242008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625472

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